一是健全政府办医主体责任机制。市委将医共体“三通”建设纳入市委深改委重点改革事项，建立工作台账；市政府定期召开机构编制、发展改革、财政、人力社保、卫生健康、医保等部门参加的专题会议，研究部署医共体建设发展等重大工作。2018年9月，印发《重庆市区县域医共体“三通”建设工作方案》，先期在3个区县试点，然后逐步扩大试点范围，截止2020年6月，全市医共体“三通”建设试点区县达25个。
二是健全部门协作监管机制。建立卫生健康行政部门牵头、医保等多部门协作的工作机制，拟制《重庆市区县域医共体“三通”建设试点监测评价实施方案》，明确对加强城乡医疗卫生服务能力建设，开展医共体“三通”试点，缓解看病贵、看病难问题成效明显的区县，在安排医疗服务与保障能力提升补助资金时予以倾斜。
三是健全医共体治理机制。成立医共体理事会，制定相关章程，明确医共体各成员单位的责任、权利和义务，建立“责任共担、利益共享”机制。
