2017年，重庆市医疗卫生投入359亿元，占一般公共预算的8.3%，增长8%，高于一般公共预算支出增长速度，努力为群众提供更加优质、更加可及的医疗卫生服务。
2017年，重庆全面推开公立医院综合改革，市财政实施分类扶持政策，引导公立医院回归公益属性，确保资金到位、改革到位。目前，市财政已投入1.54亿元，对全市调价补偿率不足90%的公立医院予以了补助。
为缓解区县压力，市财政在全额承担市级医院补助的同时，还对区县级医院按50%给予补助。2017年，全市财政拨付30多亿元支持公立医院改革，主要用于支持公立医院的基本建设和设备购置等。目前，市财政已提前下达了2018年资金，以稳步推进公立医院改革，让群众享受到更高水平的医改福利。
为支持建立多重医疗保险和救助机制，2017年，重庆投入180亿元注入医保基金，为群众看病就医撑起了一把健康“保护伞”。其中，重庆2017年将居民医保政府补助标准提高到450元，个人与政府筹资比例缩小至1∶3；深化医保支付改革，将单病种付费数量扩大到100个。
去年，重庆还调整了大病保险报销比例，由2016年的三段累进补偿简化为二段累进补偿，将报销比例提高至50%以上。重庆还建立了多层次的困难群众医疗救助体系。去年共支付医疗救助资金14亿元，救助648万余人次。该市去年投入3亿元左右，按每位困难群众100元的标准，设立了扶贫济困医疗基金。市、区两级政府共同出资，新设“惠民济困保”资助政策，资助困难群众购买商业补充保险。
重庆财政还积极促进基本公共服务均等化，缩小城乡居民基本公共卫生服务的差距。2017年，重庆提高人均基本公共卫生服务经费标准到50元，全市拨付财政补助资金15亿元，使全市3000多万群众享受到基本公共卫生服务。市财政还投入5.4亿元继续实施重大公共卫生服务项目，并下达近3亿元支持基本医疗卫生机构和在村卫生室执业的乡村医生实施基本药物制度，同时安排0.15亿元，支持村卫生室设备购置，保障基层医疗卫生机构正常运转。
