《通报》显示，2020年，住院患者中实施微创手术和三级手术的患者数量进一步增加，手术患者中实施微创手术和三级手术的患者比例均较2019年有所提高。参加考核的全国二级公立医院总体病例组合指数（CMI值）相当于2019年的1.06倍，反映出二级公立医院收治患者的疾病疑难复杂程度有所提升；低风险组病例死亡率为0.032%，与2019年相比有所下降。2020年，二级公立医院门诊和住院次均医药费用按可比价格计算，增幅分别为7.49%、6.39%，与2019年相比基本保持稳定；门诊和住院次均药品费用按可比价格计算，增幅分别为2.79%、0.42%，较2019年有所下降。
《通报》显示，2020年，二级公立医院专科能力整体得分较2019年有所提升，但不同区域、不同医院的专科能力仍然存在一定差异，如仍有个别二级综合医院科室设置不齐全，同一专科下不同医院收治的病种覆盖范围和疑难程度存在差异。
《通报》显示，2020年，参加考核的二级公立医院门诊患者满意度为85.23分，住院患者满意度为89.87分，较2019年均有所提升。二级公立医院仍需要持续巩固改善医疗服务行动计划工作成果，在合理布局院内结构、明晰引导标识、提升挂号和出入院手续办理的便捷性、加强隐私保护等方面进一步优化。医务人员满意度为76.13分，与2019年相比基本保持稳定，医务人员在同级同事关系方面满意程度较高，在薪酬福利、工作内容与环境方面满意程度相对较低。二级公立医院需进一步完善岗位设置与薪酬分配激励机制，持续提升医务人员的幸福感和获得感。
《通报》显示，2020年，约四成二级公立医院出现亏损情况，亏损医院的比例较2019年增加16.75个百分点；在亏损医院中，7.51%的二级公立医院资产负债率超过100%，49.53%的二级公立医院资产负债率超过50%。2020年，二级公立医院长短期借款类债务占负债总额的比例为29.22%，较2019年有所增加，长短期借款债务风险增大，运营风险较高。
根据《通报》，2020年，全国二级公立医院的财政拨款收入占总收入的比例为22.02%，较2019年增加9.76个百分点，增加的部分主要为疫情防控的专项补助；财政基本拨款收入占医疗活动费用比重为8.16%，较2019年增加0.82个百分点。二级公立医院医疗盈余率平均为-0.66%，较2019年下降2.73个百分点。医疗盈余的普遍减少，与医院为确保疫情防控和日常诊疗同步开展，加大防控投入、运行成本增加等因素有关。
