对于核酸阳性原因，中国疾控中心称，新冠病毒灭活疫苗由野病毒经过培养、灭活等工艺制备而成，病毒已失去感染性和致病性，但仍保留了相对完整的病毒核酸片段。接种过程中，开启疫苗瓶、抽取疫苗液、注射器排气、接种后注射器或疫苗瓶内的液体残留等，可能会以液体或以气溶胶方式，污染接种场所的接种台、墙壁、门把手、走廊、接种人员和受种者衣物等物体表面。此外，因聚合酶链反应（PCR）检测灵敏度极高，如在核酸片段被降解前进行采样，很可能核酸检测结果呈阳性。
中国疾控中心表示，鉴于各接种单位新冠疫苗接种工作将持续开展一段时间，接种场所被疫苗核酸污染的风险较高，如对接种环境进行常规监测将对疫情监测预警带来干扰，因此，不建议对接种单位常规进行环境标本采集和核酸检测。如已经开展监测发现阳性，或在疫苗接种场所附近采集的环境样本病毒核酸检测阳性，建议通过病毒全基因组测序的方式，明确核酸是否为疫苗株。
对如何做好接种组织工作和环境消毒，中国疾控中心建议：一是减少受种者的陪同人员数量，做好受种者和陪同人员的健康筛查。二是按照应种尽种原则，完成接种单位工作人员新冠疫苗接种。三是接种工作人员要采取相应的防护措施，接种工作结束后脱掉个人防护并作为医疗垃圾处理。四是保持接种单位环境清洁，在环境标本中检测出疫苗株核酸阳性时，无需采取额外的大规模消杀措施。此外，要加强新冠疫苗接种单位医疗垃圾管理，使用双层垃圾袋进行包装并扎紧封口，避免疫苗株核酸通过医疗垃圾等污染接种单位以外的环境。
